澎湖水族館位在白沙鄉，是澎湖海洋生物研究中心附屬水族館，開館超過20年歷史，經過4年休館整修，於2018年8月開放試營運，預計於2019/04/04正式開幕。

水族館擁有二層樓的展示空間，淺海沿岸生態、珊瑚礁海域、大洋生態、水母區、特展區以及長14公尺的海底隧道。入口大廳以海洋意象為主題，好像走入海底世界，讓人驚豔。展區內結合玄武岩、咾咕石牆與仙人掌等景觀，顯示澎湖在地特色。

館內動線規劃的更順暢，一路上可以看到海龜與多樣海洋生物，每天有大洋池餵食秀、觸摸體驗池可以讓小朋友摸海星與海膽等小生物，假日還有水晶寶寶與藻類DIY活動。

註：大洋池餵食秀11:00-11:15、15:00-15:15，觸摸池開放時間10:00-11:00、13:30-14:00、15:30-16:00，DIY假日11:30-12:00、14:0 0-14:30。